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技術(shù)文章首頁(yè) > 技術(shù)文章 想知道熒光探針具有哪些化學(xué)性質(zhì)嗎?
  • 想知道熒光探針具有哪些化學(xué)性質(zhì)嗎?
  • 點(diǎn)擊次數(shù):1706 更新時(shí)間:2019-11-15
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  •    熒光探針可隨所處環(huán)境的性質(zhì),如極性、折射率、粘度等改變而靈敏地改變的一類熒光性分子。
     
      熒光探針的作用用途:
      常用于熒光免疫法中標(biāo)記抗原或抗體,亦可用于微環(huán)境,如表面活性劑膠束、雙分子膜、蛋白質(zhì)活性位點(diǎn)等處微觀特性的探測(cè)。通常要求探針的摩爾吸光系數(shù)大,熒光量子產(chǎn)率高;熒光發(fā)射波長(zhǎng)處于長(zhǎng)波且有較大的斯托克斯位移;用于免疫分析時(shí),與抗原或抗體的結(jié)合不應(yīng)影響它們的活性。
      也可用于標(biāo)記待定的核苷酸片斷,用與特異性地、定量地檢測(cè)核酸的量。
     
      熒光探針的化學(xué)性質(zhì):
      熒光定量PCR所使用的熒光化學(xué)制劑可分為兩種:熒光探針和熒光染料。PCR擴(kuò)增時(shí)在加入一對(duì)引物的同時(shí)加入一個(gè)特異性的熒光探針,該探針為一寡核苷酸,兩端分別標(biāo)記一個(gè)報(bào)告熒光基團(tuán)和一個(gè)淬滅熒光基團(tuán)。探針完整時(shí),報(bào)告基團(tuán)發(fā)射的熒光信號(hào)被淬滅基團(tuán)吸收;PCR擴(kuò)增時(shí),Taq酶的5’-3’外切酶活性將探針酶切降解,使報(bào)告熒光基團(tuán)和淬滅熒光基團(tuán)分離,從而熒光監(jiān)測(cè)系統(tǒng)可接收到熒光信號(hào),即每擴(kuò)增一條DNA鏈,就有一個(gè)熒光分子形成,實(shí)現(xiàn)了熒光信號(hào)的累積與PCR產(chǎn)物形成*同步。
      實(shí)時(shí)熒光PCR技術(shù)靶基因的確定及引物和探針的設(shè)計(jì)原則
      1、靶基因的確定:選擇檢測(cè)組共有的基因以避免檢測(cè)的假陰性。
      2、檢測(cè)片段的確定:選擇檢測(cè)組內(nèi)的保守(突變少)(避免假陰性)、組間特異的序列(突變多)(避免假陽(yáng)性)作為引物探針的設(shè)計(jì)位置。片段長(zhǎng)度70-150bp。
      3、引物:長(zhǎng)度17-25bp;GC含量30-80%;退火溫度(Tm值)58-60℃;避免穩(wěn)定的引物二聚體(特別是多聯(lián)檢測(cè))及發(fā)夾結(jié)構(gòu)(自由能大于-3.5kc/m);序列不能出現(xiàn)連續(xù)的G,3’端避免G或C,后5個(gè)堿基內(nèi)避免兩個(gè)以上的G或C。
      4、探針:長(zhǎng)度20-30bp(Taqman)或16-25bp(MGB);GC含量30-80%;Tm值為68-70℃;避免穩(wěn)定的二聚體及發(fā)夾結(jié)構(gòu)(自由能大于-3.5kc/m);5’端不能是G;位置盡量靠近上游引物;選擇波長(zhǎng)差異較大(多聯(lián)檢測(cè))或Fam(單聯(lián)檢測(cè))的熒光標(biāo)記。
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